Software di visualizzazione Bioinformatics Toolbox™

di analisiper spettrometria di massa

Bioinformatics Toolbox™ fornisce algoritmi e applicazioni per il Next Generation Sequencing (NGS), analisi microarray, spettrometria di massa e ontologia genica. Utilizzando le funzioni del toolbox, è possibile leggere dati genomici e proteomici da formati di file standard come SAM, FASTA, CEL e CDF, così come da database online come NCBI Gene Expression Omnibus e GenBank®. È possibile esplorare e visualizzare questi dati con browser di sequenza, mappe termiche spaziali e clustergrammi. Il toolbox fornisce anche tecniche statistiche per il rilevamento dei picchi, l'imputazione dei valori per i dati mancanti e la selezione delle caratteristiche. È possibile utilizzare i dati ChIP-Seq per identificare i fattori di trascrizione, analizzare i dati RNA-Seq per identificare i geni espressi in modo differenziato, identificare varianti del numero di copie e SNPs nei dati microarray e classificare i profili proteici utilizzando dati di spettrometria di massa.